More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3344 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
384 aa  778    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
399 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
382 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
398 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
399 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
374 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
361 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
394 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
398 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
401 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
371 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  37.15 
 
 
370 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  43.79 
 
 
350 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.3 
 
 
372 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
371 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
389 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
414 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
389 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
378 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
377 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
367 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
374 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
376 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
362 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
409 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
439 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
392 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
369 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  25.66 
 
 
374 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
353 aa  99.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
365 aa  99.4  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.1 
 
 
365 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  26.87 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  35.91 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
367 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
386 aa  96.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
401 aa  96.3  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  26.64 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.41 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  26.48 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
383 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
421 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
368 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
386 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
763 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  26.79 
 
 
350 aa  93.6  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  26.94 
 
 
362 aa  93.2  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
385 aa  92.8  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
408 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
366 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
364 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  32.51 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  26.6 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
380 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  32.51 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
359 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
385 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  20.89 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
433 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  24.42 
 
 
370 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
366 aa  90.1  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.81 
 
 
406 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
382 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
388 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
405 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  26.4 
 
 
350 aa  90.5  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
385 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
413 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>