More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2597 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
367 aa  738    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  97.55 
 
 
367 aa  718    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  54.67 
 
 
373 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  43.73 
 
 
383 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  43.49 
 
 
389 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  35.18 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  33.6 
 
 
369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
382 aa  189  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
394 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
378 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
378 aa  126  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
398 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
377 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
391 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
376 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
385 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
382 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
355 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
390 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.6 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
389 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
377 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
392 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
407 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  29.55 
 
 
419 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  28.72 
 
 
393 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
391 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
407 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
369 aa  103  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
377 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
384 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
385 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
377 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
379 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
399 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.74 
 
 
745 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
364 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
415 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
360 aa  99.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
384 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
390 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
387 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
395 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
350 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  27.65 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
390 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
366 aa  95.9  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
373 aa  95.9  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000129984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
372 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0185  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.634207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
389 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  23.88 
 
 
745 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
394 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
388 aa  93.2  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
384 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
385 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
363 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
371 aa  92.8  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
389 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
704 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2021  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
388 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
374 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
390 aa  92  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
396 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  25.15 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
440 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
373 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3395  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
321 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
374 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
388 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>