More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1194 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 355 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  34.89 
 
 		 378 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  35.28 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  36.29 
 
 		 371 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 390 aa  105  8e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 		 748 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.79 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.17 
 
 		 369 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 435 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  31.82 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 379 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 536 aa  97.1  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 384 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 425 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 388 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 		 375 aa  94  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.67 
 
 		 356 aa  92.8  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 378 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 345 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 412 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 412 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 412 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  26.32 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1432  glycosyltransferase  24 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  27.36 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 414 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 391 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 379 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  28.4 
 
 		 401 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  31.09 
 
 		 414 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  31.16 
 
 		 416 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 393 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  27.44 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 391 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  30.58 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 446 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.46 
 
 		 388 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 417 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  26.67 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  35.93 
 
 		 404 aa  86.7  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  27.3 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.57 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 390 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  29.07 
 
 		 383 aa  86.3  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 391 aa  86.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.02 
 
 		 407 aa  86.3  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.57 
 
 		 377 aa  85.9  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  26.06 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  29.15 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  25.99 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.43 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 550 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.42 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  26.36 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>