More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2669 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
404 aa  825    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  51.54 
 
 
394 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  47.24 
 
 
410 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  46.7 
 
 
391 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  47.16 
 
 
384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  39.8 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  44.56 
 
 
390 aa  269  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  40.65 
 
 
392 aa  266  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  43.51 
 
 
393 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  44.02 
 
 
391 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 
392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
387 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 
435 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  38.07 
 
 
398 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
403 aa  189  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  27.48 
 
 
401 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
404 aa  180  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
409 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
445 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
402 aa  167  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  30.67 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
426 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
415 aa  156  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
405 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
376 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
415 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
384 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
904 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
423 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
424 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
424 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
431 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
373 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 
346 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
382 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
424 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
421 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
395 aa  103  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
445 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
382 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 
407 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  28.14 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
447 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
418 aa  93.6  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
353 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
380 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
415 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
398 aa  93.2  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
364 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  30.94 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  36.82 
 
 
411 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  35.64 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.59 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
377 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
413 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
539 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
358 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  35.11 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
445 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  38.64 
 
 
370 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
355 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
422 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  37.63 
 
 
405 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
403 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.12 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  29.76 
 
 
403 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  33.16 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.6 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3402  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
448 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.6 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  35 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>