More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1056 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
550 aa  1125    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  37.69 
 
 
409 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
441 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
414 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.89 
 
 
396 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  34.47 
 
 
367 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
362 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
421 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.81 
 
 
385 aa  94  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.66 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  37.78 
 
 
426 aa  91.3  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.89 
 
 
413 aa  90.1  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
423 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
386 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
412 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.05 
 
 
388 aa  87.4  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
378 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.56 
 
 
401 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.52 
 
 
379 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
390 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
426 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  31.96 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  31.51 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  31.51 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
426 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  36.72 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  31.51 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 
406 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
339 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  31.51 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  31.21 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.34 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  51.22 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.37 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
748 aa  80.5  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
389 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
412 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
405 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
419 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  32 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.73 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  37.16 
 
 
899 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  31.4 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  40.57 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.52 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  27.78 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
822 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  35.88 
 
 
407 aa  77  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
453 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  31.31 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  32 
 
 
468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
409 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.38 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.52 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  35.88 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  35.88 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  35.46 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0573  putative glycosyl transferase  31.19 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.478763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4202  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.11 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
821 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.8 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
821 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
819 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2078  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>