More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4504 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  85.79 
 
 
382 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  84.74 
 
 
382 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  84.74 
 
 
382 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  100 
 
 
387 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  86.32 
 
 
382 aa  669    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  74.03 
 
 
387 aa  580  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  74.48 
 
 
384 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  71.24 
 
 
387 aa  539  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  67.44 
 
 
395 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  65.28 
 
 
386 aa  505  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  57.86 
 
 
404 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  57.87 
 
 
392 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  53.23 
 
 
404 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  57.25 
 
 
398 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  57 
 
 
396 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  59.42 
 
 
386 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  53.96 
 
 
431 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  54.23 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  54.04 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  54.5 
 
 
404 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  59.4 
 
 
396 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  56.89 
 
 
395 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  53.25 
 
 
401 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  55.5 
 
 
409 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  48.67 
 
 
416 aa  382  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  55.17 
 
 
409 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  56.89 
 
 
397 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  50.86 
 
 
404 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  45.54 
 
 
404 aa  364  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  47.33 
 
 
406 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  43.58 
 
 
388 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
440 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
378 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
407 aa  123  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
391 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
355 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
394 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.18 
 
 
420 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
413 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  28.83 
 
 
650 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
672 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
419 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
413 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.19 
 
 
423 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
424 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 
439 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
482 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
434 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
430 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
414 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
396 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
450 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.36 
 
 
406 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
453 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
410 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
419 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
387 aa  106  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
458 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  32.08 
 
 
466 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
395 aa  106  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
396 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
395 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
396 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  32.4 
 
 
424 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
396 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.64 
 
 
935 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  31.46 
 
 
443 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
423 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
422 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  30.43 
 
 
417 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  30.3 
 
 
458 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
396 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
395 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
422 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  34.36 
 
 
417 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
448 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.18 
 
 
418 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
353 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.35 
 
 
427 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
402 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
434 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
399 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>