More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3718 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  100 
 
 		 397 aa  783    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  64.23 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  63.66 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  68.43 
 
 		 396 aa  494  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  63 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  62.16 
 
 		 398 aa  490  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  61.72 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  64.38 
 
 		 392 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  59.16 
 
 		 404 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  65.44 
 
 		 409 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  61.25 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  65.85 
 
 		 409 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  61.64 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  59.5 
 
 		 398 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  53.62 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  56.89 
 
 		 387 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  57.61 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  57.29 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  57.29 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  58.73 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  57.97 
 
 		 384 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  56.58 
 
 		 395 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  57.14 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  57.29 
 
 		 386 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  56.53 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  54.75 
 
 		 387 aa  388  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  54.94 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  54.16 
 
 		 411 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  50.12 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  45.39 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  44.53 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  39.95 
 
 		 388 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 419 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 414 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  33.13 
 
 		 420 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 536 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.35 
 
 		 423 aa  106  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  32.3 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.04 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 411 aa  103  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  31 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  29.56 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  31.68 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  30.28 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 		 379 aa  100  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  24.94 
 
 		 395 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 439 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  32.91 
 
 		 480 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.44 
 
 		 935 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.09 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>