More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2900 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  100 
 
 
396 aa  781    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  67.33 
 
 
404 aa  524  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  66.75 
 
 
404 aa  521  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  67 
 
 
401 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  64.9 
 
 
397 aa  518  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  63.48 
 
 
431 aa  498  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  61.63 
 
 
404 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  68.43 
 
 
397 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  68.78 
 
 
409 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  63.54 
 
 
392 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  62.25 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  64.54 
 
 
396 aa  482  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  66.5 
 
 
409 aa  477  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  62.37 
 
 
395 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  61.46 
 
 
386 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  61.07 
 
 
382 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  61.07 
 
 
382 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  59.4 
 
 
387 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  61.11 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  60.4 
 
 
398 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  54.92 
 
 
416 aa  432  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  61.07 
 
 
382 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  60.61 
 
 
384 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  58.78 
 
 
382 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  59.15 
 
 
387 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  57.29 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  60.15 
 
 
395 aa  411  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  63.61 
 
 
411 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  46.78 
 
 
404 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  50.98 
 
 
404 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  47.16 
 
 
406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  41.48 
 
 
388 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
391 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
390 aa  120  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 
438 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
398 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.46 
 
 
443 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
391 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.46 
 
 
443 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.46 
 
 
498 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
419 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.94 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.94 
 
 
499 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.94 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.94 
 
 
495 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
430 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
413 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
372 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.21 
 
 
420 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
672 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
405 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
536 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
419 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  37.15 
 
 
439 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  30.12 
 
 
442 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
358 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 
450 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
435 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
378 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
414 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  32.82 
 
 
418 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
396 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
453 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  30.1 
 
 
420 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
387 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
405 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  37.15 
 
 
439 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  37.15 
 
 
439 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  32.71 
 
 
428 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  34.88 
 
 
417 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
464 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  27.29 
 
 
407 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
395 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
411 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
414 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
446 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
424 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
384 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  30.38 
 
 
650 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.21 
 
 
935 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
375 aa  100  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 
458 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
394 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>