More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1888 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  100 
 
 
404 aa  814    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  93 
 
 
401 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  68.51 
 
 
398 aa  559  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  67.59 
 
 
404 aa  541  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  65.49 
 
 
397 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  64.18 
 
 
431 aa  534  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  65.1 
 
 
404 aa  531  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  65.76 
 
 
409 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  66.75 
 
 
396 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  63.75 
 
 
409 aa  485  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  63.66 
 
 
397 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  59.6 
 
 
392 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  58.75 
 
 
396 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  54.37 
 
 
416 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  56.7 
 
 
386 aa  418  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  54.5 
 
 
387 aa  418  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  54.18 
 
 
382 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  54.18 
 
 
382 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  55.67 
 
 
384 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  53.92 
 
 
382 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  56.68 
 
 
386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  53.92 
 
 
382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  54.86 
 
 
398 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  55.53 
 
 
395 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  52.13 
 
 
387 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  54.21 
 
 
395 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  52.9 
 
 
387 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  46.17 
 
 
404 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  51.66 
 
 
411 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  48.51 
 
 
404 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  44.12 
 
 
406 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  43.98 
 
 
388 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
390 aa  136  8e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
536 aa  132  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
391 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 
405 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
373 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
391 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
398 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  29.98 
 
 
418 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
440 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
419 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
355 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
395 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
672 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
450 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
424 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
405 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
355 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
458 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
413 aa  106  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
437 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
415 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
437 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 
405 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.73 
 
 
423 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
419 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.51 
 
 
420 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
413 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
414 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
370 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
419 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
387 aa  103  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 
439 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 
439 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
453 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
395 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
360 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.25 
 
 
431 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  26.73 
 
 
434 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  29.6 
 
 
428 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
396 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  30.63 
 
 
480 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
435 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
390 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
397 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
379 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.28 
 
 
443 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  31.99 
 
 
417 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.28 
 
 
443 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.28 
 
 
443 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  27.01 
 
 
395 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 
389 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.28 
 
 
443 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
382 aa  100  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.28 
 
 
499 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.28 
 
 
498 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.28 
 
 
495 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>