More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1174 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  100 
 
 		 387 aa  785    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  73.75 
 
 		 382 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  73.23 
 
 		 382 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  73.23 
 
 		 382 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  72.44 
 
 		 382 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  71.24 
 
 		 387 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  71.5 
 
 		 384 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  68.32 
 
 		 387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  70.13 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  64.25 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  57 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  58.21 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  57.07 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  54.43 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  57.33 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  58.42 
 
 		 395 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  58.68 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  59.15 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  52.14 
 
 		 404 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  54.14 
 
 		 398 aa  388  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  56.53 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  52.9 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  58.17 
 
 		 409 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  52.06 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  51.76 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  49.39 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  54.43 
 
 		 409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  53.66 
 
 		 411 aa  354  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  47.22 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  49 
 
 		 404 aa  346  5e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  46.77 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  42.07 
 
 		 388 aa  318  7e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  32.8 
 
 		 466 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 		 408 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 		 482 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  32.02 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 		 355 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.44 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.32 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  33.76 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  30.27 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.64 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 410 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 672 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  34.5 
 
 		 480 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 435 aa  106  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  31.35 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  30.99 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 		 439 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 		 439 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  33.02 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  33.85 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 434 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 		 450 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.88 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.72 
 
 		 423 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  34.49 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.83 
 
 		 935 aa  99.8  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 342 aa  99.4  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>