More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1668 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  100 
 
 		 411 aa  800    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  77 
 
 		 395 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  58.43 
 
 		 392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  57.14 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  59.12 
 
 		 386 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  60.83 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  55.8 
 
 		 382 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  56.52 
 
 		 382 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  56.52 
 
 		 382 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  55.9 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  53.99 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  53.6 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  55.31 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  57.55 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  58.77 
 
 		 396 aa  401  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  52.37 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  50.95 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  53.43 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  50.23 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  51.9 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  54.39 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  51.18 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  55.91 
 
 		 386 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  53.62 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  54.39 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  53.42 
 
 		 409 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  51.9 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  58.9 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  49.18 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  43.56 
 
 		 404 aa  348  8e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  46.14 
 
 		 406 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  39.95 
 
 		 388 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 672 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 440 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 398 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 391 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 419 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  33.23 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  34.95 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.55 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  31.67 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.69 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  32.03 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  34.32 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  31.83 
 
 		 384 aa  117  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 443 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 435 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 443 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 498 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 355 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 443 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 443 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 453 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 495 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  33.44 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  33.88 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  33.77 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 419 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 422 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>