More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0562 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  100 
 
 
416 aa  851    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  56.9 
 
 
404 aa  488  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  59.37 
 
 
404 aa  481  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  58.88 
 
 
431 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  57.69 
 
 
397 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  54.37 
 
 
404 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  58.51 
 
 
409 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  54.13 
 
 
401 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  54.37 
 
 
398 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  54.01 
 
 
392 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  56.64 
 
 
409 aa  418  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  54.92 
 
 
396 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  49.64 
 
 
396 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  53.62 
 
 
397 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  48.67 
 
 
387 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  49.75 
 
 
382 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  52.04 
 
 
398 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  46.52 
 
 
404 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  50.36 
 
 
395 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  48.52 
 
 
382 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  48.52 
 
 
382 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  48.28 
 
 
382 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  49.63 
 
 
384 aa  362  6e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  49.39 
 
 
387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  48.67 
 
 
386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  48.88 
 
 
386 aa  352  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  47.6 
 
 
404 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  45.99 
 
 
387 aa  350  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  44.55 
 
 
388 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  48.31 
 
 
395 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  47.78 
 
 
411 aa  328  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  42.89 
 
 
406 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.6 
 
 
536 aa  147  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
408 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
390 aa  135  9e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
391 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
391 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
405 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
373 aa  130  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 
414 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
446 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
672 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
439 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.11 
 
 
935 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
439 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
439 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
396 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.42 
 
 
650 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.29 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
422 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
417 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
396 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
498 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.88 
 
 
443 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.88 
 
 
443 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.88 
 
 
499 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.88 
 
 
495 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
355 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
355 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
396 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.34 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
413 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
438 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30 
 
 
403 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.43 
 
 
423 aa  112  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
437 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
437 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
387 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
453 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
482 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  27.9 
 
 
442 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
423 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>