More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1978 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  100 
 
 		 406 aa  836    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  48.41 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  50.49 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  50 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  48.08 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  46.12 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  45.91 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  50 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  45.67 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  45.85 
 
 		 398 aa  340  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  47.33 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  48.04 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  45.12 
 
 		 401 aa  330  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  42.89 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  44.12 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  45.72 
 
 		 382 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  43.97 
 
 		 431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  45.39 
 
 		 404 aa  318  7.999999999999999e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  45.23 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  45.23 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  45.97 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  46.77 
 
 		 387 aa  316  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  45.48 
 
 		 387 aa  315  8e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  47.16 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  44.69 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  45.48 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  45.93 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  47.7 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  45.67 
 
 		 411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  44.17 
 
 		 409 aa  303  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  47.1 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  44.53 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 387 aa  154  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 440 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30.5 
 
 		 935 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 408 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 536 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.35 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.35 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.35 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.35 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.35 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.35 
 
 		 499 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.66 
 
 		 495 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 419 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 672 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.03 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  29.75 
 
 		 414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.73 
 
 		 650 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.74 
 
 		 423 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 395 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 396 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 438 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 378 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  31.01 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  29.02 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  29.97 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  32.96 
 
 		 417 aa  120  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 434 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 414 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  30.84 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>