More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1119 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  100 
 
 		 386 aa  753    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  65 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  58.7 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  59.1 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  58.44 
 
 		 382 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  58.67 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  57.95 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  58.07 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  55.56 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  56.28 
 
 		 404 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  58.49 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  53.98 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  58.49 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  60.71 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  58.33 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  55.92 
 
 		 401 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  56.99 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  58.03 
 
 		 384 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  53.73 
 
 		 431 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  53.18 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  58.59 
 
 		 387 aa  398  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  57.25 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  53.42 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  57 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  57.88 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  56.05 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  53.51 
 
 		 411 aa  362  8e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  48.91 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  44.25 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  47.5 
 
 		 404 aa  343  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  45.07 
 
 		 406 aa  315  7e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  39.54 
 
 		 388 aa  295  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 423 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.23 
 
 		 423 aa  122  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 		 434 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 		 404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.94 
 
 		 650 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 672 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 		 482 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 430 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 440 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.8 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.9 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 536 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 373 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  33.64 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  31.11 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  34.38 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 377 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 355 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.37 
 
 		 443 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.37 
 
 		 443 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.36 
 
 		 495 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.36 
 
 		 499 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  35.39 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.27 
 
 		 443 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.27 
 
 		 443 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.27 
 
 		 498 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  33.95 
 
 		 420 aa  106  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 379 aa  105  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 391 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  34.08 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 458 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.9 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  22.9 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>