More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4001 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  100 
 
 		 382 aa  773    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  100 
 
 		 382 aa  773    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  84.74 
 
 		 387 aa  662    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  96.07 
 
 		 382 aa  743    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  84.51 
 
 		 382 aa  651    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  74.47 
 
 		 387 aa  580  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  74.8 
 
 		 384 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  73.23 
 
 		 387 aa  545  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  70.37 
 
 		 395 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  66.32 
 
 		 386 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  56.6 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  57.14 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  57.44 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  57.69 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  53.65 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  57.07 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  59.04 
 
 		 386 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  54.74 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  54.36 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  59.6 
 
 		 395 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  61.07 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  54.18 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  53.81 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  54.59 
 
 		 409 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  57.29 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  56.36 
 
 		 409 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  48.52 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  49.5 
 
 		 404 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  45.73 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  45.23 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  42.24 
 
 		 388 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 440 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 672 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 650 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  32.51 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.28 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 430 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 453 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 		 458 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.31 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.21 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  27.16 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  31.23 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  32.08 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  29.7 
 
 		 458 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 394 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.02 
 
 		 423 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  32.3 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  34.71 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 536 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  30.77 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.77 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  31.61 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 		 417 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.06 
 
 		 418 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>