More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2335 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
410 aa  857    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  60 
 
 
417 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  53.94 
 
 
413 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  53.67 
 
 
415 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  51.58 
 
 
446 aa  448  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  52.41 
 
 
408 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  49.62 
 
 
419 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  49.74 
 
 
395 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  44.39 
 
 
397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  43.29 
 
 
536 aa  352  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  44.97 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  44.97 
 
 
396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  45.14 
 
 
396 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  42.71 
 
 
935 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  43.97 
 
 
395 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  44.22 
 
 
395 aa  323  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  43.14 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  42.46 
 
 
390 aa  310  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  41.58 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  42.29 
 
 
399 aa  307  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  41.33 
 
 
398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  40.75 
 
 
395 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  41.58 
 
 
414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  41.01 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  39.66 
 
 
414 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  39.8 
 
 
391 aa  300  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  40.05 
 
 
391 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  42.64 
 
 
402 aa  293  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  39.07 
 
 
396 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  39.55 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 
414 aa  265  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  38.08 
 
 
438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 
464 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  36.78 
 
 
417 aa  242  7.999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  34.92 
 
 
414 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
417 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  34.99 
 
 
410 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 
425 aa  215  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 
410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
387 aa  208  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
435 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  32.91 
 
 
384 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  32.34 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  31.67 
 
 
395 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
379 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
379 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
379 aa  152  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
429 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
384 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
390 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
379 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
413 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
407 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  29.85 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.68 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27.38 
 
 
404 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
443 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
432 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
443 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
499 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
495 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
498 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
377 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 
439 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
436 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 
439 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
438 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
423 aa  126  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
393 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
374 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  25 
 
 
438 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  28.28 
 
 
429 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.87 
 
 
382 aa  123  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
369 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
425 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
378 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
392 aa  122  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  26.42 
 
 
396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
427 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
438 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  26.83 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
382 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
402 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  26.79 
 
 
398 aa  119  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.6 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>