More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3641 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  91.41 
 
 
395 aa  748    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  86.2 
 
 
393 aa  709    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  797    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  59.16 
 
 
537 aa  485  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  59.16 
 
 
389 aa  483  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  53.25 
 
 
387 aa  434  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  44.7 
 
 
379 aa  331  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  44.25 
 
 
379 aa  305  7e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  41.9 
 
 
390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  43.19 
 
 
384 aa  286  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  39.53 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 
379 aa  267  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
396 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
396 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 
390 aa  193  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
410 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  31.89 
 
 
395 aa  188  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
408 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 
391 aa  187  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
419 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
396 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
446 aa  179  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
398 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
391 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
391 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
415 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
414 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
399 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
395 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
536 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
414 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
396 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30.3 
 
 
935 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
397 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
464 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
436 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
434 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
402 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  26.52 
 
 
417 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
438 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
429 aa  116  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
405 aa  113  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  28.53 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  26.21 
 
 
428 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  26.63 
 
 
424 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
425 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
410 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  26.02 
 
 
438 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
413 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
456 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
353 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  24.56 
 
 
427 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
458 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  25.67 
 
 
414 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
432 aa  103  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
421 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
421 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
412 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
412 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
412 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  22.37 
 
 
405 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
387 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
407 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  25.13 
 
 
650 aa  101  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  26.03 
 
 
443 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27.21 
 
 
404 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.33 
 
 
405 aa  99.4  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  30.97 
 
 
429 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
482 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
448 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  26.89 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
435 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.25 
 
 
388 aa  96.3  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  23.47 
 
 
418 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  24.87 
 
 
466 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
377 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  25.23 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  27.07 
 
 
420 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  22.31 
 
 
405 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
448 aa  94  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  23.1 
 
 
431 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.89 
 
 
435 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  25.42 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>