More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1368 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  86.53 
 
 
395 aa  715    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  815    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  86.2 
 
 
384 aa  709    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  59.32 
 
 
537 aa  485  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  59.1 
 
 
389 aa  480  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  55.47 
 
 
387 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  44.33 
 
 
379 aa  331  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  44.25 
 
 
379 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  41.39 
 
 
390 aa  300  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  42.42 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  40.1 
 
 
379 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  38.5 
 
 
379 aa  263  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
390 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
396 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  32.41 
 
 
395 aa  193  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
396 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  31.57 
 
 
419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
410 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
408 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
387 aa  182  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
398 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
413 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
446 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
414 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
536 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
417 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
395 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
415 aa  162  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
399 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
414 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
414 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
397 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.4 
 
 
935 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
464 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
436 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  27.54 
 
 
417 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
425 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
429 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  27.62 
 
 
428 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  28.28 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
434 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  27.27 
 
 
414 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  27.59 
 
 
438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  26.84 
 
 
424 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
417 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
435 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  25.44 
 
 
427 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
413 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
407 aa  107  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
456 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
410 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
421 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
435 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
482 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
421 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
432 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
377 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  26.4 
 
 
417 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
353 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
448 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
458 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
423 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.33 
 
 
405 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  25.86 
 
 
376 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  25 
 
 
443 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  25.48 
 
 
420 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
419 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  21.84 
 
 
405 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
435 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  24.58 
 
 
650 aa  99.8  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.94 
 
 
404 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.32 
 
 
404 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  31.62 
 
 
429 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
435 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  25.98 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
448 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.45 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
357 aa  97.4  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 
405 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  25.71 
 
 
466 aa  96.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
425 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>