More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4016 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
378 aa  768    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  73.94 
 
 
377 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  43.01 
 
 
383 aa  264  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 
369 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
367 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
362 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 
382 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
385 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
376 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  34.66 
 
 
638 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
376 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.42 
 
 
369 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  33.07 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
385 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  33.07 
 
 
381 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 
376 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  32.9 
 
 
404 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
379 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 
389 aa  156  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  30.26 
 
 
370 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.96 
 
 
371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
613 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
360 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
377 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
410 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
419 aa  113  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
388 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
406 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
396 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  41.24 
 
 
414 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  31.44 
 
 
406 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
378 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
387 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
364 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
390 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
376 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.83 
 
 
396 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.23 
 
 
403 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
365 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
377 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
393 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
370 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 
373 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
398 aa  99.8  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  27.69 
 
 
360 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  34.69 
 
 
650 aa  99.8  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
391 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  33.71 
 
 
411 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
415 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.08 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  25.98 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
386 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
397 aa  97.4  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.2 
 
 
404 aa  96.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
371 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
413 aa  96.3  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  33.85 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
421 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
419 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.42 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
537 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.42 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.11 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.42 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.74 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  25.12 
 
 
395 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
417 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
422 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
405 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.95 
 
 
769 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
360 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  30.34 
 
 
468 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
391 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
404 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
386 aa  93.2  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  31.29 
 
 
383 aa  93.2  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 
382 aa  93.2  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 
770 aa  92.8  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
435 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
389 aa  92.8  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
423 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  30.28 
 
 
366 aa  92.8  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
385 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>