More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3274 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
377 aa  783    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  58.97 
 
 
376 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  57.34 
 
 
404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  53.89 
 
 
379 aa  428  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  53.76 
 
 
376 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  53.05 
 
 
381 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  53.49 
 
 
381 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  51.37 
 
 
370 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.27 
 
 
371 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  50 
 
 
369 aa  381  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  42.43 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  39.1 
 
 
377 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
367 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 
362 aa  229  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
369 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  35.36 
 
 
367 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
377 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
378 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  28.77 
 
 
638 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
389 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
385 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
378 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
613 aa  113  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
369 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
415 aa  96.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
413 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.98 
 
 
408 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
395 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
400 aa  86.3  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
419 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.52 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
379 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.65 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.64 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.74 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
404 aa  79.3  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.51 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
743 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.6 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.38 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  26.24 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  25.51 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  34.87 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.8 
 
 
769 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1156  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.656531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>