More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1802 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  100 
 
 		 404 aa  833    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  83.2 
 
 		 376 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  57.88 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  57.34 
 
 		 377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  56.64 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  56.52 
 
 		 381 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  56.79 
 
 		 381 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  53.53 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.45 
 
 		 369 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.91 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  44.84 
 
 		 370 aa  345  7e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  40.59 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  39.89 
 
 		 367 aa  242  7.999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 385 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  36.68 
 
 		 367 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  35.03 
 
 		 638 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 383 aa  140  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 613 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 387 aa  93.6  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 369 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 425 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  29.56 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4023  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  35.36 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  26.67 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 748 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  35.53 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 536 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  24.59 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.65 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.7 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1732  putative glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25.92 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 810 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.72 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.6 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.43 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.57 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04491  putative glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>