More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_71910 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  97.64 
 
 
381 aa  768    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  100 
 
 
381 aa  786    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  77.81 
 
 
376 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  62.3 
 
 
379 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  59.89 
 
 
370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  58.49 
 
 
376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  56.79 
 
 
404 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  53.05 
 
 
377 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.57 
 
 
369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.4 
 
 
371 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  45.92 
 
 
370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  43.32 
 
 
377 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  39.52 
 
 
367 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
385 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  40.67 
 
 
362 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 
367 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 
377 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
378 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
369 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
389 aa  146  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
382 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
376 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
378 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  29.66 
 
 
638 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
383 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
613 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
415 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
379 aa  93.6  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 
404 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
413 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
393 aa  89.7  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
353 aa  86.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.97 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  26.73 
 
 
426 aa  84  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  28.27 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.48 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
425 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  26.82 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04171  putative glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.116045  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  24.51 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  29.35 
 
 
803 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
346 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.43 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1590  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
468 aa  72.8  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00816719  decreased coverage  0.0063014 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.74 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  34.09 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  27.53 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
536 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>