More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1236 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
379 aa  785    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  62.83 
 
 
381 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  62.3 
 
 
381 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  62.13 
 
 
376 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  53.89 
 
 
376 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  53.53 
 
 
404 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  52.85 
 
 
370 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  53.89 
 
 
377 aa  428  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.95 
 
 
369 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.54 
 
 
371 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  47.28 
 
 
370 aa  339  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  41.51 
 
 
377 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 
367 aa  222  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 
362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
367 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
385 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  26.01 
 
 
638 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
613 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
393 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.1 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
408 aa  92.8  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
413 aa  90.1  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  26.96 
 
 
426 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  24.3 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.12 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4290  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.47 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.937919 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  28.81 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  21.36 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.48 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  26.88 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1156  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.656531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.79 
 
 
401 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25 
 
 
935 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  24.42 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
803 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.4 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1732  putative glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  26.01 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.72 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.33 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.58 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1492  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.58 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>