More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0914 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
370 aa  768    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  60.7 
 
 
376 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  59.89 
 
 
381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  59.89 
 
 
381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  57.84 
 
 
376 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  56.64 
 
 
404 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  52.85 
 
 
379 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  51.22 
 
 
369 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  51.37 
 
 
377 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.32 
 
 
371 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  41.58 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  40.37 
 
 
377 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  40.79 
 
 
367 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  40.81 
 
 
362 aa  243  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
385 aa  212  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 
369 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
382 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
378 aa  163  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
377 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
367 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  33.52 
 
 
638 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
385 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
376 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
378 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
613 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
410 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  28.25 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
373 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
358 aa  86.3  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
426 aa  86.3  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.63 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
365 aa  84  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.5 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.09 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.53 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.53 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.53 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  28.26 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  27.18 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
536 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  27.55 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
401 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
388 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.36 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.88 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.48 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.07 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.86 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  21.78 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>