More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4206 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 376 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  50.27 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  47.99 
 
 		 638 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  38.67 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  38.17 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 		 378 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 		 370 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 		 377 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  30.18 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  29.79 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  31.58 
 
 		 404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  27.56 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.64 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 443 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 443 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 498 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 443 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 443 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 499 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 495 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 		 613 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  34.09 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  40.66 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 		 438 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  42.68 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  39.66 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 		 422 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 		 413 aa  96.3  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  43.66 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  39.55 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 414 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 438 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  32.57 
 
 		 397 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  26.25 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  39.89 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 		 365 aa  89.7  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 397 aa  89.4  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.66 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  35.47 
 
 		 935 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  41.12 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  36.07 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 378 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 		 415 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 410 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  36.04 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 672 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  33.66 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 904 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.23 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>