More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5688 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 376 aa  778    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  77.81 
 
 		 381 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  78.07 
 
 		 381 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  62.13 
 
 		 379 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  60.7 
 
 		 370 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  58.22 
 
 		 376 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  57.88 
 
 		 404 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  53.76 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.01 
 
 		 369 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.15 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  47.01 
 
 		 370 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  41.78 
 
 		 377 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  39.21 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  38.17 
 
 		 385 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  40.39 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 377 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 		 367 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 378 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  29.66 
 
 		 638 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 376 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 613 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 360 aa  86.7  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  29.44 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.27 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 394 aa  79.3  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  29.86 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  27.45 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  25.42 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.19 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.01 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.63 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  23.51 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  27.6 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.48 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  27.78 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>