More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2075 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
386 aa  743    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  87.31 
 
 
386 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  53.87 
 
 
378 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  52.33 
 
 
368 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  51.79 
 
 
368 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  53.64 
 
 
377 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  53.78 
 
 
386 aa  249  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  44.54 
 
 
366 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  43.98 
 
 
366 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  42.66 
 
 
368 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  41.78 
 
 
383 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 
366 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  39.02 
 
 
371 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  39.89 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
388 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
375 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
369 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
371 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 
371 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  39.27 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  39.31 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  38.84 
 
 
471 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.92 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.92 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  39.36 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
384 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
381 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
379 aa  64.3  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
398 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
362 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  29.1 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.94 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  26.98 
 
 
392 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
380 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
387 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
387 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.35 
 
 
430 aa  59.7  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
381 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  20 
 
 
373 aa  59.7  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.35 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
428 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  33.08 
 
 
361 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  20.93 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1228  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000548043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.43 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
367 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.91 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.36 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
810 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  29.03 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1997  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.723795  normal  0.0390531 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3517  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  26.25 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
362 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  39.47 
 
 
358 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
354 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
371 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  29.03 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
408 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  26.5 
 
 
374 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>