296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3889 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 383 aa  770    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  58.06 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  56.07 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  56.07 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  55.78 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  51.57 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  41.78 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  41.03 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  38.17 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  37.19 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  43.14 
 
 		 368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  42.14 
 
 		 368 aa  199  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  39.11 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  40.75 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 		 374 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 		 371 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  36.5 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0612  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 1229 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  30.32 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.09 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  37.37 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  37.23 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.91 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.86 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  28.41 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.35 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.43 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 		 810 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.86 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  31.5 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 		 396 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  39.47 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  33.33 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 384 aa  52.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 395 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.69 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  28.69 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  31.46 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  20.53 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  20.53 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.69 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.69 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  21.2 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  20 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 535 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.69 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.69 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.69 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>