More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4383 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
535 aa  1076    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  74.44 
 
 
524 aa  677    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  53.91 
 
 
373 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  51.77 
 
 
367 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 
382 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  38.4 
 
 
370 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
386 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  35.49 
 
 
400 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
371 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  37 
 
 
370 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
374 aa  177  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
377 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
384 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
387 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
387 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
395 aa  173  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 
417 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
380 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  41.61 
 
 
431 aa  170  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
366 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
394 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 
385 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 
376 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
371 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
360 aa  163  8.000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
374 aa  160  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
381 aa  160  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  29.97 
 
 
375 aa  160  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  42.14 
 
 
397 aa  160  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
435 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
370 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 
376 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  29.97 
 
 
375 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 
380 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 
374 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
420 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  33.25 
 
 
373 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 
384 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
375 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
434 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
383 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
437 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
366 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
381 aa  146  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
382 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
370 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  30.69 
 
 
381 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
378 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
381 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  34.32 
 
 
380 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
372 aa  143  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 
382 aa  143  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
378 aa  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  32.36 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
369 aa  140  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  29.85 
 
 
374 aa  140  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  33.22 
 
 
381 aa  140  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.99 
 
 
351 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  29.63 
 
 
381 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
394 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
381 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
380 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
398 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
371 aa  136  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
394 aa  136  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
398 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
390 aa  134  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
372 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
392 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  32.82 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  39.67 
 
 
355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  36.3 
 
 
471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.66 
 
 
374 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
384 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
386 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  37 
 
 
370 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 
376 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  35.08 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
343 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
850 aa  128  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  34.08 
 
 
346 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
346 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>