More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0735 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 376 aa  753    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  94.4 
 
 		 376 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  67.47 
 
 		 376 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  67.02 
 
 		 381 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  67.29 
 
 		 381 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  63.56 
 
 		 380 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  66.76 
 
 		 373 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  58.33 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  56.4 
 
 		 380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  57.22 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  57.64 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  41.64 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 		 535 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 408 aa  155  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 386 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 400 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 398 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  37.22 
 
 		 431 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 374 aa  149  5e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 		 524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  22.74 
 
 		 381 aa  146  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 371 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  35.92 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 366 aa  135  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  28.49 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  33 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 420 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  28.65 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.2 
 
 		 364 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 434 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 361 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.17 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  28.2 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  27.82 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 435 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 		 340 aa  123  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 370 aa  122  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  33.25 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  30.38 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  27.13 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.02 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  34.02 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.02 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.02 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.09 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.02 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  31.49 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.02 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.02 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 361 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  31.54 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  25.46 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 442 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>