More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1156 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
371 aa  751    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  67.64 
 
 
343 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  44.21 
 
 
380 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  43.57 
 
 
381 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  37.14 
 
 
381 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  38.03 
 
 
384 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
398 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  41.4 
 
 
398 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 
381 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  36.46 
 
 
375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  36.88 
 
 
375 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  35.83 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
381 aa  195  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  38.11 
 
 
386 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  38.06 
 
 
371 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  39.33 
 
 
370 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
381 aa  178  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  38.26 
 
 
346 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  38.26 
 
 
346 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
366 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
360 aa  177  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  38.36 
 
 
417 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
400 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  38.68 
 
 
431 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.28 
 
 
370 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  37.22 
 
 
393 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
374 aa  169  9e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
408 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
387 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
387 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
382 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 
395 aa  166  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 
380 aa  166  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 
435 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 
384 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
366 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 
385 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.07 
 
 
375 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  38.52 
 
 
418 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  24.93 
 
 
375 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
374 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
374 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
434 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
377 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  35.69 
 
 
373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 
397 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
340 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
389 aa  143  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
366 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
437 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
370 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 
364 aa  139  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
443 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
376 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  26.42 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
375 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 
428 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  33.09 
 
 
372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  33.09 
 
 
372 aa  133  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
381 aa  133  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
384 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
380 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  35.76 
 
 
370 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  28.53 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
367 aa  127  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
378 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
423 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 
376 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
361 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
433 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
390 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
394 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.6 
 
 
351 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
361 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
359 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
359 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
359 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
464 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
382 aa  123  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  27.04 
 
 
381 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
364 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
378 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
372 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  31.99 
 
 
442 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 
364 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>