More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5687 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
376 aa  764    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  70.48 
 
 
375 aa  544  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  70.56 
 
 
375 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  43.46 
 
 
381 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  40.32 
 
 
384 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  34.92 
 
 
381 aa  232  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  38.52 
 
 
380 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 
381 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
398 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
380 aa  225  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
398 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  39.86 
 
 
382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
380 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 
417 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 
366 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  38.44 
 
 
343 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
400 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
374 aa  178  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 
431 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
408 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
366 aa  172  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
371 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
434 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
360 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 
370 aa  163  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
381 aa  163  6e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
418 aa  162  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
420 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
385 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 
346 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  36.69 
 
 
346 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
370 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
397 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
384 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
377 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.05 
 
 
375 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.18 
 
 
375 aa  156  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
371 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
382 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
387 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
374 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
387 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  30.95 
 
 
372 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
378 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  30.69 
 
 
372 aa  149  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
381 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
394 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
370 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
428 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
370 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
340 aa  143  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
366 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
375 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  32.41 
 
 
361 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  32.37 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.62 
 
 
351 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
373 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
437 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  31.41 
 
 
364 aa  132  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
383 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
374 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
1261 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  28.42 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
361 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
433 aa  127  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 
376 aa  126  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
373 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  36.39 
 
 
423 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
360 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
524 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
389 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
357 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
380 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
361 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
363 aa  122  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 
860 aa  122  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
358 aa  122  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
364 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
535 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  34.77 
 
 
859 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>