More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4202 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
373 aa  722    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  48.38 
 
 
361 aa  282  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  50.54 
 
 
364 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  48.4 
 
 
370 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  46.91 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  43.87 
 
 
408 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 
367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
384 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
400 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 
364 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
376 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
381 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
381 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  31.63 
 
 
375 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 
381 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
382 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.54 
 
 
375 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
373 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  31.83 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
370 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
363 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  39.72 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.25 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  36.15 
 
 
343 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
380 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  30.65 
 
 
382 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
366 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
398 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
374 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
381 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
371 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
418 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
377 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
370 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
354 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
398 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
382 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
375 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  33.96 
 
 
379 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 
397 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
393 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
381 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
372 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  30.49 
 
 
373 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
380 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
435 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
434 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
535 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
340 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  26.72 
 
 
372 aa  93.2  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  26.73 
 
 
372 aa  92.8  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0743  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0554251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  21.78 
 
 
366 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
524 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
428 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
394 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
433 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
361 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
440 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  21.08 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  41.72 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
382 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
376 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  21.07 
 
 
375 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
376 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  21.68 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  21.29 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  22.49 
 
 
430 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>