More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0734 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 471 aa  886    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  71.72 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  50.19 
 
 		 362 aa  217  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  48.54 
 
 		 379 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  44.63 
 
 		 354 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 		 386 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  35.74 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  36.5 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 		 381 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 380 aa  133  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 435 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 		 371 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 366 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 374 aa  123  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  35.69 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 		 380 aa  123  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  38.43 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 		 376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 		 367 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 343 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  30.94 
 
 		 374 aa  120  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 370 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 		 393 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  39.62 
 
 		 364 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 		 371 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 384 aa  116  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 		 371 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  32.72 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  32.3 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  32.3 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 		 363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 382 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 381 aa  114  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 377 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 420 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  37.12 
 
 		 394 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 		 380 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  39.01 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  35.55 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  28.68 
 
 		 336 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 		 364 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 		 376 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 		 346 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  35.07 
 
 		 346 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  33.45 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  35.9 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  31.09 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  33.45 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.37 
 
 		 351 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 367 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 		 384 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  38.43 
 
 		 370 aa  107  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  39.18 
 
 		 378 aa  107  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 		 355 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 359 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  28.14 
 
 		 364 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>