More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1042 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 375 aa  767    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3768  glycosyl transferase group 1  58.5 
 
 		 366 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  45.58 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  40.27 
 
 		 394 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  40 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 		 414 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.34 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  37.15 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  38.5 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  39.28 
 
 		 672 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  35.31 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 361 aa  206  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  38.29 
 
 		 381 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 		 376 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.16 
 
 		 361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  30.94 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.01 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  26.83 
 
 		 364 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  31.03 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 395 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 385 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.1 
 
 		 430 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 364 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3559  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23554  normal  0.448657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 400 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  24.66 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  31.13 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.32 
 
 		 351 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 377 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 376 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 420 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  23.99 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  23.99 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  23.99 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  25.54 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  26.01 
 
 		 372 aa  97.4  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 431 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 		 394 aa  96.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>