More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3625 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  96.93 
 
 		 358 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 358 aa  742    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  86.08 
 
 		 359 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  78.81 
 
 		 359 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  78.81 
 
 		 359 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  78.81 
 
 		 359 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  43.1 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.94 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  42.94 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  41.85 
 
 		 417 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.38 
 
 		 364 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  40.73 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  40.4 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 		 361 aa  269  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.22 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 365 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  39 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 		 390 aa  206  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  36.96 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 		 672 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 375 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.2 
 
 		 369 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3768  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  35.73 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 376 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  37.87 
 
 		 431 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.15 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 372 aa  135  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  34.82 
 
 		 384 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 380 aa  132  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 		 395 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  35.85 
 
 		 430 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  30.08 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 381 aa  125  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 374 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  30.35 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.96 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 437 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 393 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0340  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0102921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 		 394 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 373 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 387 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 387 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>