More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0761 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
349 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  80.52 
 
 
358 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0340  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
366 aa  186  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0102921  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
395 aa  147  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
364 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  34.73 
 
 
386 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
364 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
360 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
393 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  30.77 
 
 
364 aa  136  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
361 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.01 
 
 
369 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  33.44 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
343 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.18 
 
 
361 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.48 
 
 
351 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
381 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
361 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
381 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
400 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  30.65 
 
 
373 aa  122  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  31.96 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.59 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  24.66 
 
 
375 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  24.66 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
377 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
355 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
384 aa  116  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  25.17 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  24.93 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  29.6 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
359 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
359 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
359 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
408 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
376 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  29.35 
 
 
372 aa  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
384 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
358 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
366 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
382 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
838 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
378 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
431 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
387 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
387 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
374 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
381 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
381 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
366 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  25.62 
 
 
381 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
369 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  32.74 
 
 
381 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
398 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
366 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
366 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
371 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
394 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01937  putative glycosyltransferase WbbC  26.42 
 
 
370 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
443 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
366 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.92 
 
 
430 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
371 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
359 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  25.62 
 
 
381 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.75 
 
 
361 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  34.75 
 
 
361 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
408 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
394 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.75 
 
 
414 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.75 
 
 
414 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.75 
 
 
414 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.75 
 
 
414 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.75 
 
 
401 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
373 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3559  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
380 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23554  normal  0.448657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
417 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
434 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
423 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>