More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3768 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3768  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 366 aa  743    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  58.5 
 
 		 375 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  44.5 
 
 		 365 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  38.4 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.51 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  39.51 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.51 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.51 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.51 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.51 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.51 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 		 376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  37.05 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.9 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  40.33 
 
 		 672 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 417 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 361 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 		 358 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  36.44 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  40.34 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 366 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.81 
 
 		 361 aa  162  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.08 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 346 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  30.16 
 
 		 346 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.09 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  27.38 
 
 		 336 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  28.28 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  28.28 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  27.87 
 
 		 353 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  27.87 
 
 		 353 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  30.88 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.62 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 376 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  25.82 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3164  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 442 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  22.69 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 355 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.63 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3559  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23554  normal  0.448657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 377 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 		 370 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 395 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  26.16 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 383 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 442 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 395 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 360 aa  92.8  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  30.14 
 
 		 501 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 420 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 374 aa  89.7  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>