More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0939 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  96.33 
 
 
381 aa  738    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
381 aa  760    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  74.46 
 
 
380 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  67.29 
 
 
376 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  66.22 
 
 
376 aa  478  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  64.34 
 
 
376 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  61.39 
 
 
373 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  55.26 
 
 
377 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  53.97 
 
 
380 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  52.82 
 
 
382 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  54.67 
 
 
378 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 
380 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
535 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
393 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.88 
 
 
370 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
370 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
372 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 
417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
524 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
398 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
382 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
400 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
394 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
363 aa  139  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
369 aa  139  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
375 aa  139  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
398 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  34.01 
 
 
353 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
373 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 
360 aa  137  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
371 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
381 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 
397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  32.18 
 
 
381 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
381 aa  129  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
374 aa  126  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
382 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
435 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
394 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
377 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  33.77 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
371 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  29.56 
 
 
336 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  34.12 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
384 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3164  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  26.09 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 
361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  32.19 
 
 
361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  29.22 
 
 
419 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
380 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 
414 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 
414 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 
401 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 
414 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 
414 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  31 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
393 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
355 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
377 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
364 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
366 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>