More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1060 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  100 
 
 
376 aa  764    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  48.3 
 
 
376 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  47.53 
 
 
672 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  44.85 
 
 
381 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  39.61 
 
 
366 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 
375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3768  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 
366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 
361 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
365 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
417 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  39.44 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  35.48 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 
359 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 
359 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
359 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.95 
 
 
364 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 
371 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.93 
 
 
361 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 
359 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.4 
 
 
414 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.4 
 
 
414 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.4 
 
 
414 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.4 
 
 
414 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.4 
 
 
401 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.4 
 
 
361 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  38.4 
 
 
361 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
358 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
394 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  36.93 
 
 
340 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
371 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
351 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  32.86 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
381 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.59 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
370 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
370 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
366 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
375 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  30.57 
 
 
430 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  39.43 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
381 aa  116  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.09 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
369 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
380 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  35.28 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  30.83 
 
 
375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  31.94 
 
 
336 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
360 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
382 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0349  glycosyl transferase, group 1  40.36 
 
 
1043 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126249  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  32.77 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  29.58 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  33.19 
 
 
353 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  33.19 
 
 
353 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
374 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 
1770 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  37.87 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 
355 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  33.19 
 
 
353 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
395 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  31.53 
 
 
373 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
395 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
383 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
397 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
376 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
385 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
435 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
366 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
372 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
434 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  38.55 
 
 
428 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
394 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
358 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
376 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
366 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
366 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
442 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
355 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  37.78 
 
 
386 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>