More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6340 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 377 aa  739    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  73.4 
 
 		 382 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  62.83 
 
 		 380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  58.33 
 
 		 376 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  58.7 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  56.25 
 
 		 373 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  56.37 
 
 		 376 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  55.53 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  55.26 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  57.45 
 
 		 378 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  55.26 
 
 		 381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  37 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 434 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 393 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 435 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.52 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  35.97 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  43.03 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.59 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 380 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  32.63 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  33.81 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 535 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  31.07 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 364 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  31.73 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  32.65 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  33.42 
 
 		 361 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  34.87 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  23.7 
 
 		 381 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  23.7 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.5 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  28.48 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  28.48 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  35.57 
 
 		 423 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 		 355 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  26.9 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  35.26 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>