More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0388 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  100 
 
 
373 aa  756    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  50.14 
 
 
364 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  49.86 
 
 
355 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  47.62 
 
 
361 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  48.17 
 
 
361 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  47.47 
 
 
360 aa  333  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  46.54 
 
 
364 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  46.54 
 
 
364 aa  311  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  45.35 
 
 
353 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  38.82 
 
 
354 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  36.34 
 
 
354 aa  248  9e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
370 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.97 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 
366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
434 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
381 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
366 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  32.87 
 
 
346 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
346 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
395 aa  155  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
437 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
370 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
374 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
374 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
435 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  35.93 
 
 
408 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.02 
 
 
375 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.29 
 
 
375 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
431 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  32.23 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
382 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
400 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  36.33 
 
 
384 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
384 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
428 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
394 aa  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
386 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
369 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.59 
 
 
361 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  29.86 
 
 
381 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 
366 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 
366 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
374 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
377 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
371 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
371 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  29.51 
 
 
381 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  34.6 
 
 
375 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
381 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
444 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
397 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  33.08 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  31.75 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  31.23 
 
 
381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
420 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  30.84 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.37 
 
 
374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  38.18 
 
 
386 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
376 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
443 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
369 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
382 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
442 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
382 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
349 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
343 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
417 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
384 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>