More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3275 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
380 aa  788    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  61.54 
 
 
381 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  61.01 
 
 
380 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  45.91 
 
 
381 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  41.07 
 
 
343 aa  233  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
398 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
384 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
381 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
376 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  35.79 
 
 
375 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  35.79 
 
 
375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
408 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
400 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  39.01 
 
 
417 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
360 aa  190  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
382 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 
431 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
374 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
380 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
382 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
386 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  35.49 
 
 
385 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
371 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
435 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
384 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
393 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.68 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
380 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.41 
 
 
375 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
375 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
370 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
381 aa  159  7e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
390 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
370 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
371 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
381 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
420 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
384 aa  152  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 
395 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
370 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
373 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.62 
 
 
351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  30.39 
 
 
1219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 
364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
378 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
395 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
374 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
389 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
381 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
376 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
428 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
346 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
437 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  31.76 
 
 
346 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  34.42 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
382 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  32.65 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  32.31 
 
 
372 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
394 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  33.94 
 
 
430 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  24.66 
 
 
381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
394 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
340 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
357 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
366 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
367 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
367 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
535 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
418 aa  130  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  24.19 
 
 
381 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  30.94 
 
 
859 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
860 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
609 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
378 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
1915 aa  126  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
464 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
382 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
381 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
1261 aa  123  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
1089 aa  123  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
471 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
423 aa  123  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
393 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>