More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2579 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 1915 aa  1249    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  52.55 
 
 		 1241 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 609 aa  1257    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  53.73 
 
 		 1398 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  49.67 
 
 		 1241 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  50.08 
 
 		 1028 aa  586  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  49.34 
 
 		 1261 aa  587  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  50.08 
 
 		 1089 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  44.33 
 
 		 1229 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  43.71 
 
 		 1243 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  45.98 
 
 		 831 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  44.72 
 
 		 838 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  44.03 
 
 		 846 aa  326  9e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  43.78 
 
 		 846 aa  324  3e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 		 850 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 		 860 aa  289  8e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  39.95 
 
 		 859 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.11 
 
 		 815 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  35.07 
 
 		 1232 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  35.84 
 
 		 1219 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 		 967 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 		 395 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 374 aa  153  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 400 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  35.29 
 
 		 351 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 		 386 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 		 370 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  28.14 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  28.14 
 
 		 381 aa  144  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 		 408 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 		 376 aa  140  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  30.56 
 
 		 381 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  34.73 
 
 		 366 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1975  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 763 aa  137  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.422047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 382 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 		 370 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 378 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 		 382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 		 371 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  30.42 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  30.42 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 360 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 		 390 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 		 385 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 370 aa  127  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 380 aa  127  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 394 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 		 383 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 374 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 369 aa  126  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 384 aa  124  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 395 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 		 382 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 373 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 444 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  30.77 
 
 		 346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 381 aa  121  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 382 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 382 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2369  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 770 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 		 380 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 381 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 361 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 371 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 361 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 437 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 420 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 381 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  35.02 
 
 		 381 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 		 368 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 		 366 aa  117  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 381 aa  116  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 		 390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 374 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  33.2 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 373 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 357 aa  115  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 435 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 378 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 370 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>