More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2776 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
418 aa  844    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  33.25 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  32.75 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  33.42 
 
 
381 aa  166  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 
398 aa  162  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
376 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 
371 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
381 aa  147  5e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  29.47 
 
 
380 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
400 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
431 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
382 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
382 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
380 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
408 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 
366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
360 aa  124  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 
535 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
434 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
385 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.95 
 
 
361 aa  120  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
371 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  26.44 
 
 
430 aa  120  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  40.28 
 
 
343 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.63 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.73 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 
370 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  31.69 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  25 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  24.5 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
374 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
378 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
371 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  31.45 
 
 
372 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  31.45 
 
 
372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
366 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
375 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.68 
 
 
375 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
378 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
395 aa  113  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  26.32 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
394 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
373 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
428 aa  110  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
420 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
358 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
435 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  27.75 
 
 
1219 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
408 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
382 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
437 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 
340 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
382 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
363 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
378 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  37.87 
 
 
354 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
384 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
372 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.92 
 
 
351 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
381 aa  99.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
366 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  33.33 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  38.86 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.77 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.77 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.77 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.77 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.77 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  36.67 
 
 
379 aa  98.2  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>