More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0853 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 393 aa  802    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  49.61 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  40.05 
 
 		 382 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 372 aa  179  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  27.82 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.82 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  40.29 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 		 395 aa  169  9e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 374 aa  162  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  34.46 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  33.82 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 408 aa  159  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  37.22 
 
 		 373 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3158  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 		 408 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  24.46 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  35.84 
 
 		 409 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 393 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 		 360 aa  145  9e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  24.46 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 		 371 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 431 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 385 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  38.7 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 375 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 400 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 1261 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 378 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  37.34 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  31.54 
 
 		 430 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 383 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 380 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 384 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 535 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  32.06 
 
 		 364 aa  125  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 444 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  35.5 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  31.05 
 
 		 336 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 390 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 381 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 437 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  29.41 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  32.84 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 850 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>