More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1544 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  100 
 
 
370 aa  761    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
386 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
374 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
376 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
386 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
372 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.38 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  28.38 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
394 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
382 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
382 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
370 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
417 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  30.74 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
393 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
361 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 
377 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  26.82 
 
 
372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
378 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
370 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  26.82 
 
 
372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  25.26 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.63 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
393 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
376 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
1261 aa  109  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.39 
 
 
373 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
860 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  30.9 
 
 
859 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
357 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
378 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
380 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
457 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
371 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
381 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
380 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
381 aa  107  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
398 aa  107  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
377 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
375 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
370 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 
376 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
400 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  25.73 
 
 
380 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
1089 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
375 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
435 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
434 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  25.33 
 
 
375 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.27 
 
 
351 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  33.97 
 
 
381 aa  103  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
1241 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
384 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
373 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
609 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
378 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
349 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
382 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
380 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
383 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
376 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
1241 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  31.6 
 
 
364 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
421 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
1915 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
381 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 
366 aa  99.8  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
850 aa  99.8  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28.28 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
373 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  24.67 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  27.38 
 
 
1232 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2371  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
395 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0291756  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0725  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
361 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 
373 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
437 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.17 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
381 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
358 aa  94  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.62 
 
 
378 aa  94  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>