More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5878 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  94.4 
 
 
376 aa  700    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
376 aa  751    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  67.02 
 
 
381 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  67.82 
 
 
376 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  63.81 
 
 
380 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  67.29 
 
 
381 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  67.56 
 
 
373 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  58.7 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  55.08 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  57.03 
 
 
382 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  57.64 
 
 
378 aa  378  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  41.01 
 
 
417 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
363 aa  159  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
393 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
385 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
372 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.28 
 
 
384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
535 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 
370 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
398 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
380 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 
408 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
370 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
382 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
374 aa  151  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
397 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
398 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
369 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  34.28 
 
 
371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
381 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
431 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
381 aa  142  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
375 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  35.56 
 
 
346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
366 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
366 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
381 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
378 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
366 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
371 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
524 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  29.11 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  28.77 
 
 
336 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  34.04 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.5 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
361 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
377 aa  126  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  29.35 
 
 
372 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 
340 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  29.35 
 
 
372 aa  126  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
371 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
434 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
435 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
381 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
395 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  27.51 
 
 
374 aa  123  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
371 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 
370 aa  122  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  31.1 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  31.49 
 
 
373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
376 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
378 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
367 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
361 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  25.82 
 
 
364 aa  119  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
383 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  29.69 
 
 
353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  25.98 
 
 
381 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  30.39 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.21 
 
 
351 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  25.2 
 
 
381 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
376 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.65 
 
 
401 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>