More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0978 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
378 aa  793    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  46.05 
 
 
376 aa  349  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  43.16 
 
 
378 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  42.67 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  41.55 
 
 
374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 
372 aa  302  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 
376 aa  279  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
374 aa  160  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
417 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
370 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
393 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  31.79 
 
 
372 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
394 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
371 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
431 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  31.54 
 
 
372 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  33.83 
 
 
366 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.27 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  27.27 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
380 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
408 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
382 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
373 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
381 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
385 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
428 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
375 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
371 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
384 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
366 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
387 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
387 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
535 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
394 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
442 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
524 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
376 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
375 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  26.69 
 
 
374 aa  127  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
382 aa  126  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
366 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  30.07 
 
 
430 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
383 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1043  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
364 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
372 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.26 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
443 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
375 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
382 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 
381 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  25.95 
 
 
380 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
393 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
374 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
401 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  29.63 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
360 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
435 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  24.27 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
435 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
368 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
471 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.46 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  24.15 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>