More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3278 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
850 aa  1754    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  39.43 
 
 
831 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  39.04 
 
 
838 aa  558  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  37.75 
 
 
846 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  37.6 
 
 
846 aa  522  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.61 
 
 
815 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
860 aa  422  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  31.33 
 
 
859 aa  415  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
967 aa  325  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  40.35 
 
 
1241 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  38.48 
 
 
1915 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 
609 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
1229 aa  304  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  42.48 
 
 
1241 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  39.57 
 
 
1261 aa  300  8e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
1398 aa  300  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
1243 aa  289  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  33.84 
 
 
1635 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 
1028 aa  270  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  36.61 
 
 
1089 aa  268  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  36.56 
 
 
1219 aa  240  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  34.72 
 
 
1232 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  35.19 
 
 
431 aa  232  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
1332 aa  214  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  35.24 
 
 
460 aa  183  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  34.97 
 
 
455 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  33.73 
 
 
460 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
395 aa  170  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
374 aa  160  7e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.36 
 
 
375 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  28.12 
 
 
375 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
369 aa  155  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  32.86 
 
 
381 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  33.57 
 
 
381 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
382 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
360 aa  145  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
386 aa  146  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
381 aa  145  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
381 aa  143  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
374 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 
366 aa  140  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
384 aa  140  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
382 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  30.55 
 
 
743 aa  139  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
371 aa  138  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  32.97 
 
 
351 aa  138  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
378 aa  137  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
361 aa  137  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
376 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
375 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
370 aa  134  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
361 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
370 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
384 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
357 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.36 
 
 
361 aa  129  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
373 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
431 aa  127  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
394 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
343 aa  126  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
417 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
366 aa  125  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28.68 
 
 
353 aa  124  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
398 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
535 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
393 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  26.33 
 
 
381 aa  121  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
394 aa  120  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
372 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
408 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
524 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
400 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  24.28 
 
 
364 aa  117  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
373 aa  117  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
364 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
364 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
382 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
377 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
355 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
394 aa  114  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
370 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
369 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
420 aa  114  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
434 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
384 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
435 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  31.41 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  31.64 
 
 
419 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
395 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
383 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
387 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
372 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
380 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
390 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
387 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
390 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.04 
 
 
373 aa  111  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
428 aa  111  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
444 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  28.33 
 
 
374 aa  110  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>